中医科创建于1976年，为医院首批成立科室之一。建科伊始，就汇聚温州众多名老中医，设立中医教研室，奠定科室医疗、教学、科研“三位一体”发展特色。四十多年来，科室紧扣医院打造国家级区域医疗中心发展战略，志存高远，逐步发展成为辐射浙南闽北赣东的中医药领域高地。科室在内科、肿瘤、儿科、妇科、骨伤五大领域发力，诊务繁忙、声誉日隆。科室发展呈现临床五大专科齐头并进，高等中医药学教育与科研比翼双飞的蓬勃态势。

现中医学科构建中医内科、妇科、儿科、骨伤科及中西医结合肿瘤内科五大亚专科；教学设中医临床（内、外、妇、儿）教研室、中医基础教研室。科室为市级示范中医科及省重点专科。科室人员22名，主体为硕博士，其中国家名老中医1名、省国医名师1名、省名老中医1名、市名老中医2名、全国优秀中医临床人才1人；教授/主任医师4人、副教授/副主任医师7人，硕士生导师3名。陈捷主任为学术带头人，王建中主任为科室负责人，周奕副主任为主任助理。

科室从2002年开始招收中医学五年制本科生，为社会输送大量中医药专门人才。科室设中西医结合临床硕士点，已经培养近30名硕士毕业生。科室承担第二临床学院中医学各课程教学，以及仁济学院、“专升本”学历教育、护理学院等的中医学教学，形成了一系列教学规章和教学经验。科室在医籍整理研究、老年医学、儿科学、肿瘤学、教学科研等方面开展科研工作。出版专著12部，承担国家自然科学基金项目5项、省部委科学基金项目10项、市级科学基金项目6项。近五年发表SCI学术论文9篇、核心期刊学术论文25篇。